肝內(nèi)膽管癌是第二高發(fā)的原發(fā)性肝臟惡性腫瘤,早期診斷難,手術(shù)切除率低,惡性程度高,易累及周邊臟器和遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移,并對(duì)放化療不敏感,預(yù)后極差,術(shù)后5年生存率僅20%~30%,同時(shí)缺乏有效的靶向和免疫治療。因此,急需深入闡明肝內(nèi)膽管癌的發(fā)病機(jī)制,繪制更精確的基因及分子圖譜,為鑒定新的診治靶點(diǎn)并實(shí)現(xiàn)個(gè)體化治療提供理論依據(jù)。

2021年12月30日,國際頂級(jí)生物醫(yī)學(xué)期刊《Cancer Cell》在線發(fā)表了復(fù)旦大學(xué)(附屬中山醫(yī)院)肝癌研究所樊嘉院士團(tuán)隊(duì)的最新成果“肝內(nèi)膽管癌的蛋白基因組特征圖譜及臨床亞型”的研究論文,該研究全面解析了肝內(nèi)膽管癌的分子特征全景,為肝內(nèi)膽管癌的臨床診治提供了新思路和新策略。

樊嘉院士等團(tuán)隊(duì)合作,利用262例在中山醫(yī)院肝外科手術(shù)切除的肝內(nèi)膽管癌患者來源的樣本,綜合基因組、轉(zhuǎn)錄組、蛋白質(zhì)組、磷酸化蛋白質(zhì)組和微生物組等多組學(xué)多維度數(shù)據(jù),首次系統(tǒng)性繪制了肝內(nèi)膽管癌的多維分子圖譜,為肝內(nèi)膽管癌的發(fā)生發(fā)展機(jī)制、精準(zhǔn)分子分型、預(yù)后判斷和個(gè)性化治療策略提供了新思路。

在該研究中,樊嘉院士團(tuán)隊(duì) 建立了以蛋白質(zhì)組為核心肝內(nèi)膽管癌患者的分子分型:炎癥型(S1)、間質(zhì)型(S2)、代謝型(S3)和分化型(S4),這四個(gè)亞型在基因組、免疫微環(huán)境、治療策略、臨床預(yù)后等方面具有獨(dú)特的特征,有望指導(dǎo)臨床的個(gè)體化診治;并明確了肝內(nèi)膽管癌五個(gè)主要驅(qū)動(dòng)基因(TP53、KRAS、FGFR2、IDH1/2、BAP1)的針對(duì)性的潛在治療靶點(diǎn),深度揭示了這些突變與細(xì)胞周期、藥物代謝、炎癥-感染等生物學(xué)過程的關(guān)聯(lián)性。

此外,研究揭示了黃曲霉毒素及中草藥馬兜鈴酸所造成的基因突變指紋在肝內(nèi)膽管癌發(fā)生發(fā)展中的重要作用,為病因預(yù)防提供了線索。特別是發(fā)現(xiàn)了10%的肝內(nèi)膽管癌存在FGFR2基因的融合和突變,F(xiàn)GFR2融合蛋白不僅驅(qū)動(dòng)了肝內(nèi)膽管癌發(fā)生發(fā)展、產(chǎn)生了新的靶向治療靶點(diǎn),而且部分融合蛋白衍生的抗原肽具有較強(qiáng)免疫原性,能夠引起特異性T細(xì)胞群的激活和擴(kuò)增,也是潛在免疫治療靶點(diǎn)。

本研究是樊嘉院士團(tuán)隊(duì)繼2019年肝細(xì)胞癌分子分型登頂國際頂刊Cell、以及2019與賀福初院士團(tuán)隊(duì)合作的早期肝細(xì)胞蛋白組登頂Nature之后的又一力作。通過整合多組學(xué)數(shù)據(jù),較為完整地揭示了肝內(nèi)膽管癌的分子特征及發(fā)生發(fā)展機(jī)制,是臨床科學(xué)與蛋白組等基礎(chǔ)科學(xué)的強(qiáng)強(qiáng)聯(lián)合,在重大疾病的診斷標(biāo)志物以及治療性靶標(biāo)上取得突破性進(jìn)展。這些成果將進(jìn)一步擴(kuò)大我國在精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的優(yōu)勢(shì),推動(dòng)生物醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)的創(chuàng)新性發(fā)展,為探索腫瘤異質(zhì)性和實(shí)現(xiàn)個(gè)體化治療做出重要貢獻(xiàn)。

復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院樊嘉院士、中國科學(xué)院上海藥物研究所周虎研究員、中國科學(xué)院分子細(xì)胞科學(xué)卓越創(chuàng)新中心高大明研究員、中山醫(yī)院高強(qiáng)教授為該文共同通訊作者。中山醫(yī)院董良慶醫(yī)師、中國科學(xué)院博士生魯大運(yùn)和陳然等為該文共同第一作者。

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